煙草は国に認められて販売されてるし納税もしている。
吸うこと自体は個人の自由。
吸う場所を整備できていないファミレスがそもそも嫌煙、分煙の現代のニーズにあっていない。

危ないから消したのであれば親切。

お店が設定しているスペースで喫煙している喫煙者に文句を言ったり、勝手に人のものを使用不可能にするのはやりすぎ。
煙が気になるなら店に分煙がうまくできていないと伝えればいいし、
それでも煙が嫌なら完全禁煙の店を選べばいい。